Iho, joka elää ihollamme, tarjoaa genomisen tutkimuksen, joka auttaa ymmärtämään, miten nämä mikrobit vaikuttavat ihon terveyteen ja sairauksiin.
Mikrojen monimutkaiset yhteisöt elävät kehomme pinnalla. Näitä sieniä, bakteereja ja viruksia tunnetaan yhdessä ihon mikrobiomeina. NIH: n National Human Genome Research Institute (NHGRI) ja National Cancer Institute (NCI) aiemmin käyttämä ryhmä käytti aiemmin genomisia tekniikoita ihon bakteerien tutkimiseen. He löysivät erilaisia bakteeriyhteisöjä, jotka vaihtelivat ihmisten ja ihon välillä. Uudessa tutkimuksessaan tiimi käytti samanlaista genomista lähestymistapaa saadakseen paremman käsityksen ihossamme elävistä sienistä.
Sienet sisältävät muotteja, sieniä ja hiivaa, jota käytetään leivän ja oluen fermentointiin. Nämä mikrobit ovat liittyneet moniin ihosairauksiin ja -olosuhteisiin, mukaan lukien urheilijan jalka, ekseema, hilse- ja kynsi-infektiot. Sieni-ihoinfektiot vaikuttavat arviolta 29 miljoonaan ihmiseen. Mutta sienet voivat olla hitaita ja vaikeita kasvaa laboratorioissa, jolloin sienitartuntoja on vaikea tunnistaa ja hoitaa.
22, 2013, keräävät tutkijat 14-elimistössä 10-terveillä aikuisilla. He keskittyivät DNA: n fragmenttiin, jonka kaikki sienet olivat - ribosomaalisen RNA: n sisäinen transkriboitu välikappale 1 (ITS1), jota voitaisiin käyttää luokittelemaan sieniä sukupuolitasolla tarkemmin kuin 97%.
Luoden näytteistä enemmän kuin 5 miljoonaa ITS1-sekvenssiä, joukkue pystyi tunnistamaan enemmän kuin 80-suvun sieni-tyypit, jotka elävät ihmisen iholla. Sitä vastoin perinteiset viljelymenetelmät voivat tunnistaa vain 18-tyyppejä. löydettiin kaikilla ihoalueilla. olivat 11: n 14-kohteiden pääasiallinen tyyppi, myös korvien takana, sieraimissa, selässä ja käsivarsissa.
Tiimi totesi, että kantapäät, jotka eivät osoittaneet laajaa bakteerien monimuotoisuutta, olivat sieniille kaikkein monimutkaisimpia, noin 80-tyyppejä. Toe-verkkoilla, joissa oli noin 60-tyyppiä, ja kynnet, 40illa, oli seuraava korkein sieni-monimuotoisuus. Kädet ja käsivarret, joilla on suuri määrä bakteereja, olivat suhteellisen vähän sieniä. Ydinrungon sieniyhteisöt olivat melko stabiileja ajan mittaan, ja muutokset olivat vähäisiä, kun niitä testattiin 3-kuukausien välein. Sitä vastoin jalkojen sienet muuttivat huomattavasti 3-kuukausien aikana, mikä heijastaa ehkä enemmän ympäristöä.
Ihmiskehon sieniyhteisöt ovat monimutkaisia ja paikkakohtaisia, kertoo johtaja Dr. Heidi Kong NCI: stä. Saavuttamalla paremmin sieni- ja bakteeri-ekosysteemit, voimme paremmin käsitellä niihin liittyviä ihosairauksia, kuten sieni-infektioita, jotka voivat liittyä syöpähoitoihin.
Tutkimuksemme antamat tiedot antavat meille lähtötilanteen normaaleista yksilöistä, joita emme ole koskaan aikaisemmin saaneet ”, sanoo johtaja Dr. Julie Segre NHGRI: stä. Tärkeintä on, että jalat ovat täynnä sieni-monimuotoisuutta, joten pidä puksejasi pukuhuoneissa, jos et halua sekoittaa jalkasiita jonkun toisen sieniin.
